二代测序技术广泛应用各个研究领域：DNA测序(de novo测序及重测序)、RNA测序(转录组测序、MicroRNA测序)、ChIP-Seq、DNA甲基化、目标区域捕获测序等等。

有效分析二代测序技术产出的海量数据，需要采用有效的数据挖掘策略。这些策略包括高效比对原始序列片断，序列片断的聚类及基因组注释等等。

我们的分析服务包括：序列组装(de novo 组装及重测序组装)、全基因组重测序分析，转录组分析（RNA测序分析）、 SNP/Indel相关分析、CNVs相关分析以及表观遗传学测序分析等等。

                  图1  下机数据前期处理流程

图2. RNA-seq数据后期分析流程

服务内容

什么时候会用到分析服务呢？

1.当你有一些来自SNP芯片或者微阵列数据，以及蛋白质组学或者代谢组学的实验数据时（多层次的数据分析服务）

2.当有一些较小的基因、蛋白质、或者化合物列表需要分析时（客户化定制通路，分析服务，论文发表服务）

3. 当有单个的基因，蛋白质或一些你感兴趣的化合物需要以此为核心获取更多相关知识和信息时（整合性的多层次分析，客户化定制通路分析，论文发表服务）

服务项目

  根据客户需求定制，以满足客户的要求。一些常见的项目类型包括：

1.客户化定制通路分析

 当您需要了解在一个让你感兴趣的系统中的关键基因或者关键的过程，验证实验性的假设，了解化合物的生理作用功能，或者只是想更好地了解你所关注的基因和生理功能之间的联系，上海丰核 的科学家将按照客户的特殊要求通过创建一个互交式的通路反映出您所感兴趣的基因或者化合物和其他的生理过程（如疾病，信号传递通路，表型，药物靶点）之间的关系。

2.数据上传和分析服务

 上海丰核科学家们准确地先将用户的数据转换为一定格式，然后上传数据集，并运行分析以理解如下的生物现象与机理， 如时间与剂量效应的生物影响， 如在各种不同的病人人群之间的主要机制区别，又如细胞及疾病过程的分子机理的深层关系，以及机体生理及病理生理之间的关联性。 另外，您将收到一个文档，描述工作如何开展，参数如何选用，并获得一个结果的报告文档。

3.发表服务

 如果您没有时间去完成一篇能在顶尖出版物上发表的文章，我们将会创建交互的，可直接用于发表的，且生理上准确的生物通路来帮您清楚地把您的核心思想表达于您的发表文章或者演示文档中。 另外还可以生成参考文献列表，便于您直接用于需要发表的文献上。

  所有的服务也包括一个完整的参考文献列表，用于完成整个项目并有一个与我们的顾问科学家一对一的咨询过程，以便您能够了解方法，数据参数，和结果的其他方面的重要信息，能深入探讨以确保你的问题已经得到解答。