1， 确定已知基因的启动子上转录因子结合位点， 2， 确定已知的转录因子在给定的靶基因是否存在结合位点。
图中标注出已知的转录因子Oct-1，cdxA,hsf2,sry,mzf1,cdxA等TF,在这条序列上存在结合位点，并且相应的得分都>90 (TFSEARCH结果). 图中带箭头的虚线表示对应的TF结合的方向以及区域。
