| 宁静致远 |
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我在网上看到如何根据目的基因检测microRNA,上面说“目前为止看到的文献中比较完整的预测步骤是这样的:首先采用几大预测数据库预测;第二步取几个数据库结果的交集;第三步将交集中的靶基因的靶位点周围约70nt的flanking sequence用mfold求自由能;第四步去掉自由能高于物种平均自由能的靶基因。这样做下来剩下的靶基因就不多了。再结合已有文献中对这种microRNA的组织分布和时空分布的数据,这样来寻找最可能的靶基因也许会有些收获。”上面第三、四步我不是很懂. 我现在正在做microRNA方面的课题,目的基因为Gli3,我已经用RNA22等4种软件预测出近30种microRNA,现在如何进一步筛选。 |
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| 丰核信息工程师 |
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