代谢组学

实验介绍
    代谢组学(metabolome)是研究某一时刻细胞内所有代谢物的集合的一门学科。代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。其样品主要是尿液,血浆或血清,唾液,以及细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振(NMR ),液-质联用(LC-MS),气-质联用(GC-MS),色谱(HPLC,GC)。
     NMR的灵敏度最低,能检测并定性的物质少于100个,其优势是简单,无损伤,可定量。全二维GC-MS,物质的数量一般在1千个以上。LC-MS检测物质的数量要比GC-MS少一些,一般100个以上。

目前研究的方向主要有:
1、氨基酸代谢组学(Amino metabolomics)——定性定量检测游离的氨基酸的种类
2、脂质组学(Lipidomics)
根据脂质分子在不同pH 值条件下带电倾向的差异,通过调整样品的pH 值,改变脂质分子的离子化倾向,并结合ESI正、负离子检测模式的切换,达到离子化过程中分开检测不同脂质分子的目的,最后利用串联质谱技术进行分析鉴定和定量
3、靶标代谢组学 (Target metabolomics)——定量检测生物医学样品中的代谢小分子
4、药物代谢组学(Pharmaco-metabonomics)——通过给药前生物样本的代谢轮廓分析预测给药后的药物反应表型
5、微生物代谢组学(Microbial metabolomics)——主要进行胞内代谢物的分析
6、植物代谢组学 (Plant metabolomics)——定性和定量分析植物的某一组织或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物
7、医学代谢组学(Medical metabonomics)——研究生物体被扰动后其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律
实验方法
1、样本收集(血样,尿样等)
2、代谢物的提取
3、上级检测(NMR, LC-MS,GC-MS)
4、质谱下级数据预处理
5、结果分析-主程序分析(PCA)和偏最小二乘化-判别分析(PLS-DA)等
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